Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11bQ6DFW5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp11bQ6DFW5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms