Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rftn1Q6A0D4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms