Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
N4bp1Q6A037 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
N4bp1Q6A037 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
N4bp1Q6A037 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
N4bp1Q6A037 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
N4bp1Q6A037 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
N4bp1Q6A037 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
N4bp1Q6A037 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
N4bp1Q6A037 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
N4bp1Q6A037 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
N4bp1Q6A037 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms