Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdk13Q69ZA1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk13Q69ZA1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk13Q69ZA1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk13Q69ZA1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk13Q69ZA1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk13Q69ZA1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk13Q69ZA1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk13Q69ZA1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms