Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno1Q689Z5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms