Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VclQ64727 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VclQ64727 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VclQ64727 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VclQ64727 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VclQ64727 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
VclQ64727 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VclQ64727 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VclQ64727 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VclQ64727 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VclQ64727 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VclQ64727 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VclQ64727 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VclQ64727 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VclQ64727 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VclQ64727 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VclQ64727 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VclQ64727 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms