Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprdQ64487 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PtprdQ64487 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PtprdQ64487 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PtprdQ64487 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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PtprdQ64487 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PtprdQ64487 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PtprdQ64487 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PtprdQ64487 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprdQ64487 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms