Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f3Q63955 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms