Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms