Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa13Q62424 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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