Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TsnQ62348 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TsnQ62348 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TsnQ62348 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TsnQ62348 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsnQ62348 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms