Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Spock1Q62288 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spock1Q62288 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms