Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Sall3Q62255 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms