Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phox2aQ62066 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms