Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Npm1Q61937 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Npm1Q61937 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms