Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AtrxQ61687 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms