Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli3Q61602 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms