Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erbb3Q61526 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms