Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd55bQ61476 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms