Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msi1Q61474 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msi1Q61474 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms