Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsx2Q61412 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsx2Q61412 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms