Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde3bQ61409 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pde3bQ61409 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde3bQ61409 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde3bQ61409 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms