Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AcanQ61282 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms