Protein–RNA interactions for Protein: Q61235

Sntb2, Beta-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb2Q61235 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntb2Q61235 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntb2Q61235 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntb2Q61235 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms