Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxg1Q60987 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms