Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf3Q60980 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf3Q60980 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms