Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms