Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms