Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csnk2a1Q60737 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a1Q60737 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms