Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samhd1Q60710 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms