Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CttnQ60598 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CttnQ60598 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CttnQ60598 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms