Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd5Q5VCS6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms