Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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