Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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