Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms