Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zzef1Q5SSH7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zzef1Q5SSH7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms