Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bod1Q5SQY2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms