Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smg7Q5RJH6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg7Q5RJH6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms