Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav6-2Q5R1I4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav6-2Q5R1I4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms