Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms