Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim58Q5NCC9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim58Q5NCC9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms