Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm12185Q5NCB2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms