Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp28Q5I043 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp28Q5I043 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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