Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trpm3Q5F4S9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm3Q5F4S9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms