Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms