Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufaf2Q59J78 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms