Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spire1Q52KF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spire1Q52KF3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms