Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C2cd3Q52KB6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms