Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms