Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc27a5Q4LDG0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc27a5Q4LDG0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms